I det 78. minutt satte Stian Kristiansen inn 2–1 for Sandefjord og deretter 3–1 ved Aleksander Damnjanovic Nilsson.
Det ble også sluttresultatet.
Trener Erling Moe måtte stå skolerett for Molde-supporterne etter matchen.
– Vi må be om unnskyldning til dem som bruker penger på å følge oss, sier Moe til TV 2.
– Vi må bare legge oss flate for dem. De har all grunn til å være forbannet. Dette er så dårlig. Det er langt under den standarden vi har.
– Det vi leverer, er på et bunnivå som jeg ikke har vært med på før, fortsetter en tydelig skuffet Moe.
– Det er dramatisk for Molde, sier Simen Stamsø-Møller i TV 2-studio - og påpeker at Bodø/Glimt samtidig vinner.
På hjemmebane vant Glimt 1–0 over Strømsgodset.
– Vi ser ut som et Obosliga-lag i denne 1. omgangen, sa Magnus Wolff Eikrem til TV 2 i pauseintervjuet.
– Vi må bare legge oss paddeflate, sier Eikrem til TV 2 etter matchen.
– En utrolig svak prestasjon. Terningkast én.
Fredrik Gulbrandsen ga oppskriftsmessig Molde ledelsen i det 34. minutt. Han hamret ballen via tverrligger og ned. Isak Amundsen sto for assisten.
Sandefjord utlignet i det 64. minutt og hadde før det hatt en scoring annullert. Med det blotte øye var det umulig å se, men VAR dømte at Eman Markovic var i offside.
Simon Amin sto bak 1–1-scoringen etter forarbeid fra Christopher Cheng.
2–1-målet kom da Stian Kristiansen raget høyest på Filip Ottossons innsvingte corner. Han headet ballen i mål via en Molde-rygg.
Molde våknet etter scoringen, og Erling Moes menn jaget utligning på Vestfold-kysten.
Det var en kanonade mot Sandefjord-målvakt Hugo Keto mot slutten i en kamp med syv minutter tillegg i 2. omgang.
På overtid var det en dobbeltsjanse ved Kristian Eriksen og Halldor Stenevik - men Keto var i det umulige hjørnet.
Så satte Sandefjord spikeren i kista med 3–1. Det var et fantastisk forarbeid av Danilo Al-Saed som ydmyket Molde-forsvaret før han la ballen på sølvfat til målscorer Aleksander Damnjanovic Nilsson.
– Vi har jobbet hardt, og i dag får vi endelig lønn for strevet, sier Nilsson til TV 2.
– Vi holder oss til kampplanen. Det er derfor vi vinner.
Sandefjord har hatt en fæl sesongstart både i ligaen og i cupen, der de røk ut i første runde borte mot Fløy.
– Jeg synes vi vinner fortjent, sier Sandefjord-trener Hans Erik Ødegaard.
– Vi har samme tilnærming mot alle motstandere. Men det er selvfølgelig enda bedre å gjøre det mot en god motstander som Molde.