Navarro nektet å forklare seg for kongresskomiteen som gransket stormingen av kongressbygningen 6. januar 2021. For dette ble han dømt til fire måneders fengsel.
Den Harvard-utdannede 74-åringen er den hittil øverste tjenestemannen i Trump-administrasjonen som må tilbringe tid i fengsel etter stormingen.
Navarro ba høyesterett om å få utsatt soningen inntil en anke er ferdigbehandlet, men fikk ikke medhold.
Han fastholder fortsatt at Trump tapte valget i november 2020 som følge av valgfusk.
– De som har ført meg langs denne veien til fengsel er fordømte demokrater og Trump-hatere. Jeg skal med stolthet sone straffen min, sa han tirsdag.
Steve Bannon, som regnes som en av arkitektene bak Trumps valgseier i 2016, ble dømt til fire måneders fengsel av samme grunn som Navarro i januar. Han har anket dommen og er foreløpig en fri mann.