Boluarte mistenkes for korrupsjon, og rundt 40 politifolk deltok i lørdagens aksjon.
Ifølge politiet ble det blant annet lett etter kostbare Rolex-klokker, som presidenten mistenkes for å ha mottatt uten å oppgi.
61 år gamle Boluarte er Perus første kvinnelige president og tiltrådte i desember 2022.
Politiet innledet etterforskning av Boluarte etter at en avis avdekket hvordan hun ved flere anledninger hadde dukket opp med svært kostbare klokker på armen, klokker som hun ikke har oppgitt å ha i sin eie.
Boluarte hevder at hun har hatt den ene klokken siden 18-årsalderen, men har ikke opplyst hvordan hun har fått minst to andre.
Den peruanske avisen El Comercio skriver at ransakingen av presidentens hjem startet fredag klokken 22.55 lokal tid. Dette skjedde etter et vedtak av høyesterettsdommer Juan Carlos Checkley Soria torsdag, skriver avisen.
Påtalemyndigheten ba retten om å utføre denne ransakingen i forbindelse med en etterforskning de har startet for påstått ulovlig berikelse. Den omfatter presidentens bosted og en Honda registeret i hennes navn, fortsetter El Comercio.
Ifølge avisen skal aktor Hernán Mendoza ha uttalt foran den peruanske kongressens tilsynskomité at Boluarte har «forhindret» å vise frem Rolex-klokkene ved flere anledninger. Hun skal også ha unnlatt å møte til avhør.
Påtalemyndigheten i landet hadde bestemt at Boluarte skulle vise frem tre Rolex-klokker på tirsdag, skriver avisen videre. Presidenten skal bedt om å få flyttet på denne datoen. Aktor Juan Carlos Villena skal ha kritisert henne for å skylde på en «overbelastet tidsplan» ifølge et skriv El Comercio fikk tilgang på denne uken.